Na de Reformatie werd de openlijke viering van de katholieke mis verboden. De katholieken kwamen bijeen in schuilkerken. De mooiste 17e-eeuwse schuilkerk van Nederland was de Gertrudiskapel (ingang naast kathedraal). Naast de kapel is tussen 1912 en 1914 een grotere kerk gebouwd, die nu de zetel van de oudkatholieke aartsbisschop is, dus een kathedraal. Het ontwerp is van E.G. Wentink in een sobere neoromaanse stijl, maar met een rijk gedecoreerd interieur. De voorgevel van de kerk kijkt inmiddels weer uit over de in ere herstelde singelgracht.
